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11 February 2013 Emergence of a New Genotype of Avian Infectious Bronchitis Virus in Brazil
Aline Padilha Fraga, Eder Balestrin, Nilo Ikuta, André Salvador Kazantzi Fonseca, Fernando Rosado Spilki, Cláudio Wageck Canal, Vagner Ricardo Lunge
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Abstract

Infectious bronchitis virus (IBV) is the agent of a highly contagious disease that affects domestic fowl (Gallus gallus). Recent reports showed a high prevalence of one main IBV genotype (Brazil or BR-I) with low genetic diversity in commercial poultry flocks from Brazil. This research analyzed IBV positive poultry flocks from different rearing regions to verify the S1 gene variability and geographic distribution of variant IBV strains in recent years (2010 and 2011). Samples of IBV-positive flocks were obtained from 60 different farms. Forty-nine partial S1 gene sequences were determined and aligned for phylogenetic and amino acid similarity analyses. Eleven samples (22.4%) were similar to Massachusetts vaccine strains (Mass genotype) and 34 samples (69.4%) to the previously characterized Brazilian BR-I genotype. Interestingly, the remaining four samples (8.2%) clustered into a new IBV variant genotype (Brazil-II or BR-II), divergent from the BR-I. A unique nucleotide sequence insertion coding for five amino acid residues was observed in all the Brazilian variant viruses (BR-I and BR-II genotypes). These results show a higher genetic diversity in Brazilian IBV variants than previously described.

Aparición de un nuevo genotipo del virus de la bronquitis infecciosa aviar en Brasil.

El virus de la bronquitis infecciosa (IBV) es el agente de una enfermedad altamente contagiosa que afecta a las gallinas domésticas (Gallus gallus). Los reportes recientes muestran una alta prevalencia de un genotipo principal de este virus (Brasil o BR-I) con baja diversidad genética en las parvadas avícolas comerciales de Brasil. Esta investigación analiza las parvadas avícolas positivas a la presencia de este virus en diferentes regiones, para verificar la variabilidad del gene S1 y la distribución geográfica de las cepas variantes de este virus en los últimos años (2010 y 2011). Se recolectaron muestras del virus de bronquitis de parvadas positivas en 60 granjas diferentes. Se determinaron 49 secuencias parciales del gene S1 y se alinearon para llevar a cabo análisis filogenéticos y de similitud de aminoácidos. Once muestras (22.4%) fueron similares a la cepa vacunal Massachusetts (Mass) (genotipo Mass) y 34 muestras (69.4%) fueron similares a la cepa brasileña previamente caracterizada, genotipo BR-I. De manera interesante, las cuatro muestras restantes (8.2%) se agruparon en un nuevo genotipo variante (Brasil-II o BR-II), que es divergente de la BR-I. Una inserción única en la secuencia de nucleótidos que codifica para cinco residuos de aminoácidos se observó en todos los virus variantes de Brasil (genotipos BR-I y BR-II). Estos resultados muestran una mayor diversidad genética de las cepas variantes brasileñas del virus de la bronquitis infecciosa a diferencia de lo que se había descrito anteriormente.

American Association of Avian Pathologists
Aline Padilha Fraga, Eder Balestrin, Nilo Ikuta, André Salvador Kazantzi Fonseca, Fernando Rosado Spilki, Cláudio Wageck Canal, and Vagner Ricardo Lunge "Emergence of a New Genotype of Avian Infectious Bronchitis Virus in Brazil," Avian Diseases 57(2), 225-232, (11 February 2013). https://doi.org/10.1637/10346-090412-Reg.1
Received: 4 September 2012; Accepted: 1 February 2013; Published: 11 February 2013
JOURNAL ARTICLE
8 PAGES


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