Newcastle disease (ND) is a highly contagious viral disease and has been a constant threat to the poultry industry worldwide. In this study, partial sequences of ND virus (NDV) fusion genome collected from some provinces in Iran during 2010–2012 in vaccinated commercial farms were characterized and compared with other NDV sequences. All viruses showed the amino acid sequence 112 RRQKRF117 at the C-terminus of the F2 protein and phenylalanine at the N-terminus of the F1 protein, residue 117. These amino acid sequences were identical to a known virulent motif. The phylogenetic analysis showed that the Iranian ND isolates in this study are closely related to the genotype VIId of class II NDV strains. The emergence and identification of new sublineages provide an insight into the high rate of genetic drift occurring in NDV strains in Iran, and raise many concerns about the efficacy of current ND control measures in the country.

Caracterización molecular y estudio filogenético de virus de la enfermedad de Newcastle aislados en Irán entre los años 2010–2012.

La enfermedad de Newcastle (ND) es una enfermedad viral altamente contagiosa y ha sido una amenaza constante para la industria avícola en todo el mundo. En este estudio se caracterizaron las secuencias parciales del gene de la proteína de fusión de virus de Newcastle obtenidos de algunas provincias de Irán entre los años 2010–2012 de granjas comerciales vacunadas. Dichas secuencias también se compararon con las de otros virus de Newcastle. Todos los virus mostraron la secuencia de aminoácidos 112 RRQKRF117 en el extremo terminal C de la proteína F2 y mostraron fenilalanina en el extremo terminal N de la proteína F1, que es el residuo 117. Estas secuencias de aminoácidos eran idénticas a un motivo que es conocido se asocia con la virulencia. El análisis filogenético demostró que los virus de Newcastle iraníes aislados en este estudio estaban estrechamente relacionados con cepas del genotipo VIId de la clase II. La aparición e identificación de nuevos sublinajes dan una idea de la elevada tasa de derivación genética que está ocurriendo con las cepas de Newcastle en Irán y plantean muchas preocupaciones acerca de la eficacia de las actuales medidas de control contra esta enfermedad en el país.