Phyllostomid bats are a keystone group in the succession of Neotropical plant communities and knowledge of their diet is essential in the study of bat–plant interactions. The most used method to date has been taxonomic identification of the seeds found in bat feces, but this approach underestimates plant species with large seeds that cannot be ingested. With the aim of estimating how much our knowledge of the diet of frugivorous bats changes once we include those species of plants that are underrepresented, we determine the diet of 3 bat species using 18S rDNA V9 metabarcoding. Results were compared with those obtained from morphological identification of seeds found in feces. Using metabarcoding, we identified 20 plant species and with taxonomic identification of seeds, 10 species, with the latter being a subset of the first method. Metabarcoding made it possible to detect a greater number of interactions as well as a greater percentage of the samples were determined to species level. Fifty percent of the plant species (8 species) recorded in the diet of Sturnira hondurensis, 62% (8 species) for Carollia perspicillata, and 50% (4 species) for Artibeus lituratus were exclusively detected with metabarcoding. Plant species with fleshy fruits including Clusia lundellii, Annona cherimola, and Saurauia pedunculata were exclusively detected with metabarcoding and an important item in the diet. The incorporation of molecular biology to determine the diet of 3 species of frugivorous bats made it possible to demonstrate that their diet is more diverse than previously known. Hence, in the field of plant–bat interactions and knowledge of the natural history of species, it is important to consider this new form of analysis.
Los murciélagos filostómidos son un grupo clave en la sucesión de las comunidades de plantas neotropicales y el conocimiento de su dieta es esencial para el estudio de las interacciones murciélago-planta. El método más utilizado hasta la fecha, ha sido la identificación taxonómica de las semillas encontradas en las heces de murciélagos, pero este enfoque subestima las especies de plantas con semillas grandes que no pueden ser ingeridas. Con el objetivo de estimar cuánto cambia nuestro conocimiento sobre la dieta de los murciélagos frugívoros cuando incluimos aquellas especies de plantas que están subrepresentadas, determinamos la dieta de tres especies de murciélagos utilizando metacódigo de barras 18S rDNA V9. Los resultados fueron comparados con los obtenidos mediante la identificación morfológica de semillas encontradas en heces. Usando metacódigos de barras identificamos 20 especies de plantas y 10 especies mediante identificación taxonómica de las semillas; siendo este último, un subconjunto del primer método. Los metacódigos de barras permitieron detectar un mayor número de interacciones, y un mayor porcentaje de muestras fueron determinadas hasta el nivel de especie. El 50 % de las especies de plantas (ocho especies) registradas en la dieta de Sturnira hondurensis, el 62 % (ocho especies) en la dieta de Carollia perspicillata y el 50 % (cuatro especies) en Artibeus lituratus fueron detectadas exclusivamente con metacódigos de barras. Se destacan especies de plantas con frutos carnosos como Clusia lundellii, Annona cherimola y Saurauia pedunculata, porque son un elemento importante en la dieta de los murciélagos y porque fueron detectadas exclusivamente con el metacódigo de barras. Los murciélagos frugívoros son importantes dispersores de semillas y la presencia de estas últimas en las heces de los murciélagos son una clara evidencia de este servicio ecológico. Sin embargo, la incorporación de la biología molecular para determinar la dieta de tres especies de murciélagos frugívoros permitió demostrar que su dieta es más diversa de lo que se conocía hasta ahora. Por lo tanto, en el campo de las interacciones planta-murciélago y para el conocimiento de la historia natural de las especies, es importante considerar esta nueva forma de análisis.
