Introduced species are one of the leading causes of declining global biodiversity and result in many billions of dollars of losses to the bioeconomy worldwide. Introduced species have become increasingly common due to globalization and climate change, and population genetics is a useful tool for the management of such species. The Eastern Fox Squirrel (Sciurus niger) is a highly successful invader that was introduced to many states in western North America throughout the 20th century. We used low-pass whole genome sequencing to evaluate phylogeographic structure across native and introduced ranges of this species and identify the putative number and geographic sources of introductions in California and Utah. We found minimal patterns of phylogeographic structure, consistent with recent range and population expansion since the Last Glacial Maximum. Additionally, we found evidence for multiple mitochondrial haplotypes in California and only 1 haplotype in Utah, which suggests that fox squirrels in California were sourced from multiple introduction events while those in Utah were likely sourced from a single event. Genomic resources generated in this study will be useful for future conservation efforts in this species and will assist with the ongoing management of its introductions across western North America.

Especies introducidas son una de las principales causes de la disminución mundial de la biodiversidad y resultan en pérdidas de miles de millones de dólares para la bioeconomía mundial. La genética de poblaciones es un instrumento útil para el manejo de estas especies, cada vez más comunes debido a la globalización y el cambio climático. La ardilla zorro oriental (Sciurus niger) es una especie invasora exitosa que se introdujo en muchos estados del oeste de América del Norte a lo largo del siglo XX. Utilizamos secuenciación de baja cobertura del genoma para evaluar la estructura filogeográfica de la ardilla zorro oriental a través sitios nativos e introducidos, para identificar el número de introducciones en los estados de California y Utah, y para determinar orígenes geográficos de estas introducciones. Encontramos una señal mínima de estructura filogeográfica, consistente con la reciente expansión de rango y población de esta especie desde el ultimo Máximo Glacial. Además, encontramos múltiples haplotipos mitocondriales en California y solo uno haplotipo en Utah. Esto sugiere que en California, la ardilla zorro oriental se originó de múltiples eventos de introducción, mientras en Utah se originó a partir de un solo evento. Los recursos genómicos de este estudio serán útiles para futuros proyectos de conservación de esta especie y ayudarán con la gestión de sus introducciones en el oeste de América del Norte.